งานทำโปรตีนบริสุทธิ์ ขึ้นอยู่กับปฏิสัมพันธ์จำเพาะ ระหว่างโปรตีนเป้าหมายและ immobilized ligand โดย เมอร์ค มีสารหลายชนิดเพื่อใช้ในงาน affinity purifying tagged recombinant protein, antibody purification, nucleic acid purification, protein-protein interaction studies, และ albumin/IgG depletion from serum or plasma ซึ่งสามารถใช้ในงานทำโปรตีนบริสุทธิ์อีกด้วย